商标如果在马德里国际商标注册系统和欧盟商标注册中发生商标冲突，需要进行相应的解决措施。以下是可能采取的一些步骤：

商标搜索：在提交商标注册申请之前，建议进行全面的商标搜索。这包括在马德里系统和欧盟商标数据库中搜索相似或相同的商标。商标搜索可以帮助您确定是否存在与您的商标相似或相同的已注册商标。

商标冲突评估：如果发现与您的商标相似或相同的已注册商标，建议进行商标冲突评估。这可以通过请专业商标代理机构或律师进行商标相似性分析和评估来进行。他们可以帮助您确定是否存在商标冲突，并提供相应的解决方案。

商标异议或撤销程序：如果您的商标申请受到马德里系统或欧盟商标注册的异议，您可能需要参与商标异议程序或撤销程序。这可能涉及提交证据、陈述观点以及与对方进行商标冲突的争议解决。

协商和许可协议：在某些情况下，您可以与商标持有人进行协商，以达成商标许可协议或其他解决方案。商标持有人可能同意您在特定地区或领域内使用商标，以避免商标冲突。

法律诉讼：如果商标冲突无法通过协商解决，可能需要考虑提起法律诉讼。这需要咨询专业的商标律师，他们可以为您提供法律建议，并代表您在法庭上进行辩护。

需要注意的是，解决商标冲突是一个复杂的过程，可能需要专业知识和经验。建议在遇到商标冲突时寻求专业的商标代理机构或律师的帮助，以确保您的权益得到妥善保护。